শুক্রাণু তৈরি হয় পুরুষ অন্ডকোষের (শুক্রাশয়) অভ্যন্তরে। শুক্রাশয়ের অভ্যন্তরে মিয়োসিস বিভাজনের মাধ্যমে স্পার্মাটোজেনেসিসের দ্বারা শুক্রাণু উৎপাদিত হয়। স্পার্মাটোজেনেসিসের প্রক্রিয়াটি 65-75 দিন সময় নেয়। প্রতিটি শুক্রাণু কোষ গঠনে প্রায় 250টি কোষ অংশগ্রহণ করে।
শুক্রাশয়গুলি উদর গহ্বরের বাইরে একটি থলির মধ্যে অবস্থান করে, একে অন্ডকোষ বা স্ক্রোটাম বলে। স্ক্রোটাম একটি পেশীবহুল থলি যা নিয়মিত সংকোচন ও প্রসারণ করে শুক্রাশয়ের তাপমাত্রাকে নিয়ন্ত্রণ করে। শুক্রাশয়ের স্বাভাবিক তাপমাত্রা 34-35 ডিগ্রি সেলসিয়াস। এই তাপমাত্রা শুক্রাণু উৎপাদনের জন্য আদর্শ।
শুক্রাণু তৈরি হওয়ার পর সেগুলি এপিডিডাইমিসে সঞ্চিত থাকে। এপিডিডাইমিস একটি লম্বা, কুণ্ডলাকার নল যা শুক্রাশয়ের সাথে যুক্ত থাকে। বীর্যপাতের সময় শুক্রাণু এপিডিডাইমিস থেকে বের হয়ে ভাস ডিফারেন্সে প্রবেশ করে। ভাস ডিফারেন্স একটি পাতলা নল যা মূত্রনালীতে উন্মুক্ত হয়। বীর্যপাতের সময় শুক্রাণু মূত্রনালী দিয়ে বেরিয়ে আসে।
প্রতিদিন প্রায় 300 মিলিয়ন শুক্রাণু উৎপন্ন হয়। এই শুক্রাণুগুলির মধ্যে মাত্র কয়েকটি ডিম্বাণুর সাথে মিলিত হতে পারে।
